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当局安排次要密谋者为苏格兰女王的审判和定罪作证。这些记载和共谋表露：她图谋危害女王的人命和王国的肤浅。伊丽莎白的某些枢密重臣反对告状玛丽，以为一女子受到严实监视、身患重病，约略不久就会当然牺牲。
因此政府无须出此下策，自有磐石之安；况兼审判帝王，前史鲜有其例。莱斯特建议：在狱中给玛丽奥密下毒。他派一位神学家向沃尔辛海姆论证此举的正当性。但沃尔辛海姆对此默示厌恶，赞同大大批阁臣的意见：公开审判苏格兰女王。迄今为止，英格兰和英国大臣的地位确乎累卵之危。王位摄取东谈主莫得肃肃公布，但国民渊博招供的血统摄取东谈主受上帝教讲授，是英格兰国教的死敌。由此，大臣和大贵族的个东谈主安全和众人安十足受到多重威胁，完全系于女王的人命，而女王年纪已高。因此，伊丽莎白的阁臣深知玛丽对他们疾恶如仇，于是对她无所无谓其极，急欲珍贵她登上英格兰王位，比伊丽莎白我方更为抨击。
其中一篇论文研究中，Adam Phillippy和“端粒到端粒”(Telomere-to-Telomere)联盟报道了完整的人类Y染色体的62460029个碱基对序列。这次的组装纠正了当前人类参考基因组组装中关于Y染色体的多个错误，同时还向参考基因组中添加了逾3000万个碱基对，揭示出多个基因家族的完整结构，并确认41个新的蛋白质编码基因。这次的结果还纠正了微生物组研究中提出的假设，这些假设将之前未知的人类Y染色体序列错误归类为细菌序列。
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英格兰举国熟知巴宾顿密谋破获，但苏格兰女王的一切谈路都受到严实监视，仍然一无所知。托马斯·戈格斯爵士奉伊丽莎白之命，告诉她悉数同党表露、被捕的音书时，她才大吃一惊。他选择玛丽骑马、打猎回来的时间，向她吐露实情。玛丽莫得获准复返本来的住所，不息从一处名流宅第迁往另一处名流宅第，临了才假寓在北安普敦郡的弗塞林格城堡，在这里恭候临了的审判和遇难。玛丽的两位文牍坐窝被捕。她的悉数文献遭到检讨，送交枢密院，发现了六十多种不同密钥。其中有好多外洋来信，也有几封英国贵族的来信，抒发尊重和爱戴之情。玛丽不知谈信件表露，但她的揣度东谈主知谈，他们以为，除了晓示从此跟苏格兰女王不共戴天除外，无法补赎其放肆之罪。
伸开剩余78%当局决定：审判玛丽，不以频繁的大逆罪法案为依据，而所以上一年度专诚为此通过的法案为依据。伊丽莎白根据该法案，委任钦使合议，包括四十名贵族和阁臣CYL688.VIP，授权他们审理和宣判苏格兰废君、苏格兰先王詹姆斯五世摄取东谈主玛丽的罪戾。钦使来临弗塞林格城堡，派沃尔特·米尔德梅爵士、阿米亚斯·鲍勒特爵士、爱德华·巴克将伊丽莎白的信件递交给她。信件讲演她钦使来临城堡，审判行将驱动。玛丽闻讯，声色不动。她只说：
女王待朕如臣民，命朕受臣民审判，实乃咄咄异事。朕身为独处邦国的绝对帝王，寰宇一东谈主，唯辟作威。东谈主主之尊、邦国之权、太子之位之阶，断无贬损之理。运交阳九、壮志依然，不负敌东谈主谬赞，讳饰图画信史，竟为卑屈无状所污。英格兰法律、典章，朕实无所悉。朕内乏阁臣襄赞；不明何物小子乃以苏格兰世卿自居，甚或高踞法曹、臧否东谈主君。朕虽客居英格兰多年，然身为俘虏，未受此邦法律保护。客居原非自发，称臣尤属无稽。朕以东谈主主之尊，乐于委曲下顾，自解于英格兰国会，至矣尽矣。所谓钦使除名合议云云，假法律举止之优孟衣冠、篡臧否生杀之权，朕心未见其可。朕今正告列位：内疚神明、怜悯羽毛，毋以肆虐无辜为务。列位反躬自问：寰球之大、令人瞩目，岂戋戋英格兰王国可比；暗室亏心，何足以填中外之议、杜悠悠之口？
钦使从头简任代表，回复玛丽：她的陈辞无论以王室尊荣还所以囚禁地位为理据，都不成采信。他们除名审判此案，即使玛丽拒却出庭，举止仍将陆续。大管库伯利、大法官布罗姆利各有论证，试图劝她从命，但副家宰克里斯托弗·哈顿爵士的论据最有劝服力。他就此发言说：“夫东谈主，你受到谗谄敝国涂油加冕女王的指控，但并不决罪。夫东谈主自称女王，但本案原为弑君大罪。王室尊荣既不受平庸、训诲法律节制，也不受当然法、万执法统治。夫东谈主如果确乎无罪，却遁藏审判，殊非珍贵令誉之举？夫东谈主业已抗辩无辜，但伊丽莎白女王另有见解，遣使开庭固非彼至心之愿。女王陛下简任钦使，原为澄清长短。钦使诸公齐以体面、审慎、耿直著称，准备一秉大公乃至回护保全，听取夫东谈主抗辩，乐见夫东谈主洗刷诬枉。吾辈临行之际，彩娱乐专线女王毋庸置疑：夫东谈主染指逆谋，女王至心悱恻。夫东谈主翻案有望，女王亦当红运。微臣鄙人，愿明心迹，断无欺蒙夫东谈主之意。援引王室特权，殊为有害。公开向法庭讲明注解皑皑，更有裨益。就此保持千里默，例必遗羞青史。”
他巧为设辞，劝服玛丽出庭，法庭因此取得正当举止的神气。玛丽如果相持貌似合理的王权和独处性表面，法庭例必堕入种种艰辛，如今得以幸免。她的这种作念法只可视为愈加放肆，因为伊丽莎白的法庭本来从无自称对她有统治权，唯有经她原意和招供后能力介入审判。她如果深爱荣誉胜过人命，就应该相持拒却受审自辩。
玛丽第一次出庭时，要么意志到我方的放肆，要么仍然不肯意自甘臣吃法庭，于是再度抗议法庭的巨擘性。大法官援引规矩：任何东谈主假寓英国，就要受到英执法律最高巨擘的统治。钦使团呐喊将抗议和回话记载在案，纳入举止。
随后，王室讼师驱动对苏格兰女王提倡指控。他们用截获的信件讲明注解：她允许艾伦伯爵和其他东谈主尊她为英格兰女王；她奥密聚会佩吉特勋爵和查理·佩吉特，引西班经纪东谈主入侵英格兰王国。玛丽似乎并不急于澄清这两项指控。她只说：别东谈主写信愉快用什么称号，她不可能窒碍。不择时期复原开脱，是她正当的权柄。
随后，玛丽致门多萨的信件呈现公堂。她在信中承诺：如果她男儿拒却改宗上帝教，就将她对英格兰王国的权柄转让给菲利普。她在信中说：只消詹姆斯受到苏格兰臣民的逼迫，这种事情就不可能发生。致使发展到这一步，她仍不肯劳神否定，仿佛默示承认。她说：她并莫得不错转让的王国，但她有权柄转让属于我方的东西，莫得义务对任何东谈主解释我方的作念法。她补充说：她当年拒却了西班牙的提议，但目下她对英格兰依然透顶颓废，因此下定决心不再拒却外助。堂上还提倡了根据：她命艾伦和帕森斯赴罗马有计划转让条件，将英国王位交给菲利普，以劫夺异端男儿詹姆斯的摄取权。
值得珍贵的是：其时玛丽对男儿怀有极大的坏心，致使加入了反对他的密谋。她任命克劳德·汉密尔顿勋爵为苏格兰监国，唆使她的提拔者劫驾，将小詹姆斯交给教皇或西班牙国王。威迫他唯有改宗上帝教，能力离开。
玛丽只明确否定了指控的一个部分：参与刺杀伊丽莎白。这一条件确乎是最严重的，唯有这一条能充分讲明注解女王对她片瓦无存的梗直性。王室讼师为了讲明注解指控的真确性，向法庭提供了以下根据：玛丽和巴宾顿通讯的副本，是国务文牍沃尔辛海姆的办公室遏止下来的，她在信中明确默示赞合谗谄女王；玛丽的两位文牍劳和卡尔里作证，他们莫得受刑，都承认玛丽收到巴宾顿这些信件，他们再根据玛丽的呐喊撰写复信；巴宾顿承认这些信是他写的，复信亦然他收到的；巴拉德和萨维奇承认玛丽和巴宾顿用私语通讯，巴宾顿给他们看过这些信件。
彰着，这些根据纵横交错。一切根据都相宜一般性论断，但最终的决定性根据有赖于两位文牍的证词。他们我方笃定熟知女主东谈主参与了巴宾顿密谋，但他们如果拒却提供当局提取的根据，就会濒临扣留、拷打、严刑的严厉科罚。如果是寻常的罪人案件，除非有违抗的根据、动摇了证东谈主的确凿度，这么的根据虽有种种不及，仍然足以视为正当，致使充分的。但在目下的审判中，告状方掌捏了绝对权力。他们给被告女王定罪，有紧要的利益关系和侵君倾向。两位证东谈主即使品格端方，暴政和不公的可能性仍然甚大，有待于摈斥。必须承认，针对玛丽的根据，并非全无价值。巴宾顿收到的复书上有玛丽的签字，这难以解释，致使不可能解释。
玛丽莫得获准跟外界通讯CYL688.VIP，他们用私语揣度，揭示了出现的问题，致使在一切表露后，仍然不错提示咱们这方面的判断。因此，不及为奇：苏格兰女王莫得参谋人，惑于分手惯例的审判，无法在钦使眼前灵验地狡辩。她的答辩主淌若我方的否定。由于她明确否定跟巴宾顿有任何揣度，而这个事实自己至少是确凿无疑的，因此她的悉数否建都变得愈加病弱无力。她声称：劳和卡尔里宣誓为她守密、效忠，因此他们提倡不利于她的根据，不应采信。不外，她承认：劳当年为她舅父洛林红衣主教效力，法兰西国王引荐给她，称此东谈主不错相信。她也承认：卡尔里极其老诚，但无邪浑厚，容易受劳影响。如果这两东谈主收信、复书，莫得见告她，那么她以为歪曲不可能落到她身上。她补充说：她更倾向于怀疑他们，因为劳在其他情况下有近似的冒失举动——试图不经她原意，就以她的模样做事。
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